При копировании папок в Linux через Nautilus файлы копируются не последовательно, как в Windows, а в случайном порядке, а может быть, даже и паралельно. Это приводит к тому, что на дешевеньких mp3 плеерах, которые игнорируют имена файлов и дату, и сортируют треки в порядке их записи на флеш-память плеера, становится невозможно слушать аудиокниги — mp3 файлы идут в случайном порядке, очередность файлов нарушается.

Такая проблема не у одного меня.
Решения два:

1. Копировать папки с mp3 через Midnight commander
2. Использовать fatsort:
   Если ваш mp3 плеер определяется как /dev/sdb, нужно сделать

fatsort /dev/sdb

Узнать куда в /dev/ ссылается плеер можно в System -> Administration -> Disk Utility.